Se evalúa de forma multidisciplinaria diversos tópicos del ambiente marino, desde aspectos físicos, químicos, geológicos y biológicos de los ecosistemas costeros y oceánicos de la región y de ambas costas del país, en diferentes escalas de tiempo y espacio mediante modelación numérica y observaciones in situ o mediante la utilización de imágenes de sensores remotos.

Se considera también la interacción de los procesos geomorfológicos que afectan la línea de costa y el fondo marino. Con todo ello, se amplía el conocimiento de los ecosistemas marinos, lo cual nos permite elaborar modelos que nos expliquen los cambios en estos ambientes como resultado de los fenómenos naturales o inducidos por el hombre, cuyas manifestaciones tienen efectos para los recursos marinos y el clima. Cuenta con un personal de 22 académicos, dos técnicos académicos y un técnico administrativo.