Desarrollo de Tecnologías

Fecha: 2 Febrero de 2012                          Hora: 10:00 a.m.

Lugar: Auditorio del CICIMAR

Ponente: Dr. David Alfaro Siqueiros Beltrones

ESTRUCTURA DEL INFORME CIENTÍFICORESUMEN

Más allá del orden sistemático que se persigue en un formato convenido para la presentación de los informes científicos, es decir, de las publicaciones en sus varias modalidades, existe la intención de lograr una estructura que refleje el proceso mismo de la investigación llevada a cabo en un determinado campo de la ciencia. Esta estructura la provee el Método Científico extendiendo su filosofía (de la investigación) a la comunicación científica. De acuerdo con esto, el informe científico habrá de incluir imprescindiblemente en sus apartados: un indicador conciso de qué se ha investigado, es decir, el problema de estudio plasmado en un título; el planteamiento de dicho problema sobre la base del análisis inquisitivo y lógico de la teoría respectiva, lo cual implica un propósito (enriquecer la teoría) con lo cual se logra una introducción que lleva hacia el o los objetivos, i.e., responder la pregunta hecha y/o aquellas que al responderlas (objetivos particulares) permitan resolver el problema (objetivo general); la hipótesis, es decir la respuesta probable al problema (o pregunta), también sobre la base de dicha teoría; la estrategia de trabajo (variables de interés y forma de muestreo), métodos y técnicas utilizados (de campo, laboratorio, o numéricas), preferentemente justificando su validez (metodología); los resultados y su interpretación, básicamente dirigidos hacia la confirmación o no de la hipótesis y cumplimiento o no del objetivo. Finalmente, examinamos la congruencia entre lo esperado y lo obtenido analíticamente (discusión), lo que sopesa nuestro propósito y nos lleva a emitir conclusiones. Dentro de todo este proceso identificamos la lógica científica en sus distintas formas: inducción, deducción, abducción, análisis, síntesis, mismas que se aplican en distintas etapas del estudio y apartados del informe, para el examen y generación de teoría (comprendida en la bibliografía, literatura citada y por citar). Como científicos estamos obligados a percatarnos de ello, de tal manera que se logre la estructura del informe de acuerdo con lo que representa cada uno de sus apartados. Sin embargo, existen otros factores que influyen en la publicación de dichos informes, tales como: ámbito de la revista, política editorial, impacto, circulación (difusión), y sobre todo, la calidad del informe.

Normatividad del Seminario Departamental,

En el primer seminario del Departamento (jueves 26 de Enero)  se presentará la normatividad que se aplicará a los estudiantes y, en la segunda hora del seminario, se presentará una plática sobre la Unidad de Protección Civil del CICIMAR, por el MC. José Reyes Hernández.

La cita es a las 10:00 horas, en el Auditorio del CICIMAR, se agradecerá sean puntuales en este y todos los seminarion.

Fecha: 8 de Diciembre de 2011                          Hora: 11:00 a.m.

Lugar: Auditorio del CICIMAR

Ponente: Elena Stephanie Castro Silva

Evaluación de la actividad anticoagulante “in vivo” de polisacáridos sulfatados extraídos de Macrocystis pyrifera.

RESUMEN

En la actualidad, la búsqueda de compuestos con actividad anticoagulante análoga a la  heparina y con mínimos o nulos efectos secundarios ha adquirido vital importancia. Se conoce que el mucílago de la pared celular de las macroalgas es rica en polisacáridos sulfatados derivados de fucanos y se les considera una fuente abundante de nuevos activos anticoagulantes. En años previos, el grupo de Química de Algas Marinas del CICIMAR-IPN han realizado estudios sobre el recurso algal de Baja California Sur como potencial fuente de polisacáridos sulfatados y han logrado obtener polisacáridos con actividad comparable a la heparina en ensayos in vitro. En este proyecto de investigación se están evaluando fracciones de un extracto acuoso del alga café Macrocystis pyrifera con actividad moduladora de la coagulación sanguínea “in vivo e in vitro”. Para llevar a cabo lo anterior se extrajo 1kg de alga a 55°C en agitación constante, el tejido se removió y el material líquido sometió a centrifugación. La solución clarificada fue sometida a un fraccionamiento sólido-líquido en DEAE-celulosa con  eluyentes de NaCl a 0.5, 1 y 2M. Los precipitados obtenidos se secaron en estufa eléctrica a 50º C  obteniéndose cuatro fracciones F0 E1 (7.073g), F1 E1 (2.1265g), F2 E1 (2.2251g), F3 E1 (1.097 g) que posteriormente se sometieron a pruebas de tiempo de protrombina (TP) teniendo inhibición del coagulo de 378, 43, 278 y 54.5 s respectivamente. De estas fracciones se llevaron a cabo espectros de infrarrojo mostrando bandas de absorción a los 1255 cm^-1 atribuida a la vibración de los enlaces de los grupos sulfato y a 815 cm^-1 que se podría deberse a la torsión de los grupos éster sulfato. Para poder realizar las pruebas in vivo se está llevando un periodo de capacitación en el manejo de animales del laboratorio según la norma oficial mexicana (NOM-062-ZOO-1999) bajo la dirección del Dr. Amaury Cordero en el bioterio CIBnor. Así también, los análisis de química sanguínea se encuentran en proceso de ajuste en las concentraciones de reactivos debido a que la sangre obtenida en la extracción vía intracardiaca es menor a los estándares establecidos en dichas técnicas.

Fecha: 8 de Diciembre de 2011                          Hora: 10:00 a.m.

Lugar: Auditorio del CICIMAR

Ponente: Alejandro Marín Álvarez

TITULO: Actividad antimicrobiana y citotóxica de extractos de Codium spp., recolectadas en Baja California Sur, México.

RESUMEN

El aumento de la resistencia de los microorganismos patógenos a los antibióticos es un efecto colateral inevitable por el uso de éstos. El objetivo es evaluar la actividad antimicrobiana y citotóxica de los extractos y productos naturales aislados a partir de Codium amplivesiculatum, C. simulans, C. fragile y C. cuneatum  recolectados en diversas localidades costeras de Baja California Sur, México. Las algas recolectadas fueron secadas al sol y preservadas a -20° C hasta el momento de ser utilizadas. Se obtuvieron extractos etanólicos de cada especie. Dichos extractos fueron fraccionados utilizando una combinación de técnicas cromatográficas en búsqueda de sus compuestos activos. Los extractos crudos, fracciones y los compuestos aislados se evalúan para determinar su potencial antibacteriano contra Mycobacterium tuberculosis (microdilución en caldo), Escherichia coli, Streptococcus pyogenes, Staphylococcus aureus, Vibrio parahaemolyticus, V. alginolyticus y V. harveyi (difusión en agar con sensidiscos). La actividad citotóxica de los compuestos puros aislados se evalúa frente a líneas de células tumorales MDA-MB-231 (carcinoma de mama), A-549 (carcinoma de pulmón) y HT-29 (carcinoma de colon). Las fracciones 3, 4, 5, 6 y 13 del extracto de Codium amplivesiculatum, fueron  activas contra Staphylococcus aureus y las fracciones  4, 5, 6 y 13, 14, 15, 16 y 17  contra Streptococcus pyogenes. Las fracciones de C. simulans, 3, 4, 5 y 11 fueron activas contra V. parahaemolyticus, mientras que 1, 2, 3, 4, 5 y 10 resultaron activas contra V. alginolyticus  y V. harveyi. La fracción CC2F2 del extracto de C. amplivesiculatum  mostró potencial contra Mycobacterium tuberculosis, a una CIM de 100 µg/mL. A partir del extracto de C. amplivesiculatum se han aislado 4 productos naturales de los cuales se identificó el clerosterol, un esterol con actividad citotóxica. Los tres restantes se encuentran aún en proceso de caracterización estructural por medios espectroscópicos.

Revisó: Director de tesis.

Fecha: 24 de noviembre de 2011                                     Hora: 10:00 a.m.

Lugar: Auditorio

Ponente: Sonia S. Valencia Agami

VARIACIÓN TEMPORAL Y BIOACTIVIDAD DE LOS PRODUCTOS NATURALES MAYORITARIOS DE LA ESPONJA Aplysina gerardogreeni DEL GOLFO DE CALIFORNIA.

Fecha: jueves 17 de Noviembre de 2011                Hora: 10:00 a.m.

Lugar: Auditorio

Ponente: David A. Siqueiros Beltrones

SEUDOCIENCIA NON FINGO

RESUMEN

Carecer de una respuesta clara y precisa a preguntas como ¿ qué le confiere a una investigación su carácter científico ? o ¿ en que consiste la estructura de una investigación científica ? evidencia la falta de un contexto filosófico que aclare porqué se es científico. Así, se realiza investigación científica desconociendo sus bases, desconociendo su filosofía, o menospreciándola. El resultado es el riesgo de confundir el quehacer científico con sus técnicas. Esta es la seudociencia que no hemos intentado reconocer y que puede crecer como bola de nieve; aquella que perjudica. Contrario a lo que usualmente se ha entendido como seudociencia, i.e., Astrología y otras supercherías, cómodamente referidas o inventadas como seudociencias, se pretende identificar y advertir de la existencia de una verdadera seudociencia, la cual no inventamos (non fingo).  Se exhorta a los estudiantes de ciencias a tratar de entender o reforzar su idea de lo que es realmente la filosofía de la ciencia y los riesgos de no dedicarle la atención que amerita. Desde estudiantes de secundaria y preparatoria interesados o curiosos de la investigación científica, hasta aspirantes de científico, podrán seguir esta argumentación, y en el mejor de los casos, recurrir a un diccionario filosófico para aclarar conceptos. Muchos colegas podrán aprovechar este punto de vista también, lo que les permitirá argumentar con bases sólidas el carácter científico de su investigación.

Fecha: 10 de Noviembre de 2011                Lugar: Auditorio del CICIMAR

Hora: 10:00 a.m.

Ponente: cDr. Martín Ramírez Orozco

RESUMEN  SEMINARIO III

La búsqueda de nuevos antibióticos o moléculas con actividades similares es un proceso muy lento, que por lo general consiste en un “screening” de poblaciones naturales de microbiota, plantas o animales, de origen marino o terrestre y a la fecha se ha visto rebasado por el surgimiento de las cepas resistentes a los productos comerciales. Es por ello que resulta primordial la búsqueda de nuevos compuestos que permitan controlar el crecimiento de las cepas patógenas y cuya búsqueda sea más rápida y efectiva. El uso de los fagos, o de los compuestos que se obtienen de ellos parece ser una buena alternativa para este fin, toda vez que el número de fagos que existen en la naturaleza es enorme y por tanto, la fuente de posibles herramientas para el control de bacterias se antoja inagotable. En el presente trabajo se propone el uso de péptidos de fagos que permitan el control del crecimiento de Vibrio parahaemolyticus, como una alternativa al uso de antibióticos tradicionales, aprovechando el ciclo de infección del fago y la especificidad por la bacteria. Para ello, se trabajó con la selección de una cepa de fago lítica para Vibrio parahaemolyticus, se implementó un método para el aislamiento y purificación del DNA del fago, se verificó su identidad con enzimas de restricción y se obtuvo su peso molecular aproximado mediante electroforesis comparativa con un digerido enzimático del fago lambda. Se obtuvo su secuencia genómica por secuenciación masiva de última generación y se emplearon diversas herramientas bioinformáticas para su análisis. Mediante el CLCbio, se obtuvo el número de genes que componen el genoma, mediante el ExPASy se obtuvieron los marcos de lectura de cada gen, y mediante un análisis de ambos softwares más el Blastx de la NCBI, se determinó su expresión, obteniéndose la secuencia de aminoácidos para cada marco de lectura codificable. Las secuencias codificables de los marcos de lectura fueron comparadas con la base de datos del  GenBank de la NCBI. El genoma de VPMS1 resulto ser un fago nuevo (no reportado aun) en la base de datos de genomas de la NCBI, compuesto por 57 genes,  29 con función conocida y 28 con función desconocida.

Con el CLCbio se seleccionaron los marcos de lectura codificantes para péptidos y con la ayuda del APD se determinaron características como peso molecular, hidrofobicidad, persistencia de aminoácidos característicos e índice de Boman, seleccionando aquellas moléculas de péptidos con características potenciales de actividad antimicrobiana. Los péptidos seleccionados fueron enviados a sintetizar (lifetein) y posteriormente se ensayará mediante antibiogramas y microcinéticas microbianas su actividad antimicrobiana in vivo. Una vez seleccionados aquellos péptidos con actividad antimicrobiana real, se buscará la región de la bacteria sobre la que actúan mediante lisis celular y cromatografía de afinidad en columna. La región bacteriana se purificará y se obtendrá su secuencia de aminoácidos mediante espectrometría de absorción atómica acoplada al sistema TOF (MALDITOF) y al sistema de Electro Spray. Se determinara la especificidad de la interacción entre el péptido del fago y la región “Diana” de la bacteria mediante un análisis de doble híbrido. Los resultados serán comparados con aquellos existentes en las bases de datos internacionales.

Palabras clave: Fagos, Vibrio parahaemolyticus, péptidos antimicrobianos, genoma, Dianas.

Fecha: 3 de noviembre de 2011                      Lugar: Auditorio

Hora: 10:00 a.m.

Ponente: Luis Carlos Cejudo Licea

TITULO:

EFECTO DE UN EXTRACTO  DE Macrocystis Pyrifea  SOBRE EL DESARROLLO Y CRECIMIENTO DE VEGETALES.

RESUMEN

El uso de extractos de alga para estimular el crecimiento vegetal ha cobrado importancia en la agricultura y relevancia en la investigación. Estudios muestran beneficios en absorción de nutrientes, germinación, establecimiento de trasplantes, enraizamiento, floración, frutos, rendimiento entre otros. Este estudio es la continuación de un proyecto que inició en 2010  en CICIMAR, donde se desarrolló una metodología de extracción utilizando Macrocystis pyrifera, estableciendo las condiciones de temperatura y pH para extraer la mayor parte de los componentes algales, lo cual se ha demostrado con respuestas fisiológicas en distintos pruebas con vegetales. En esta nueva fase del proyecto se instaló un sistema con condiciones controladas de temperatura y horas luz, y se elaboraron 9 extractos. Se pretende determinar el  efecto que puede tener diferentes proporciones de solvente a diferentes tiempos de extracción y su efecto en germinación, desarrollo radicular, crecimiento y eficiencia en la tasa de absorción de nutrientes en distintas concentraciones. Los resultados preliminares en una aplicación al 10% de concentración del extracto, muestran un mayor desarrollo radicular a mayor concentración de solvente.

(Faltaron las palabras clave).

Fecha: 27 de octubre de 2011                      Lugar: Auditorio

Hora: 10:00 a.m.

Ponente: TITULO: “fisiología digestiva durante EL Desarrollo LARVAL del pargo Lunarejo Lutjanus guttatus”

RESUMEN

El estudio de la fisiología digestiva es un tema importante en especies que han sido introducidas en la acuacultura, y cuyas técnicas de cultivo y alimentación aún están en desarrollo. Tal es el caso de Lutjanus guttatus, de la cual se han reportado protocolos de crianza larvaria con elevadas tasas de mortalidad que pueden estar asociadas a la capacidad digestiva de las larvas, la cual se desconoce. Bajo este marco, la presente propuesta pretende describir e integrar aspectos ultraestructurales y fisiológicos de la capacidad digestiva durante el desarrollo larval de L. guttatus. Específicamente, el desarrollo del tubo digestivo y órganos accesorios mediante microscopía electrónica de transmisión, lo que permitirá establecer las bases ultraestructurales de la capacidad digestiva; la actividad de las enzimas digestivas fosfatasa ácida, fosfatasa alcalina, tripsina, quimotripsina, amilasa, lipasa, leucina aminopeptidasa y pepsina, por medio de métodos colorimétricos utilizando sustratos específicos para cada enzima; la caracterización enzimática a través de análisis electroforéticos sobre las proteasas ácida y alcalina, lipasas y amilasas; y la expresión genética por medio de PCR tiempo real de las enzimas digestivas tripsina, amilasa y lipasa y de la hormona gastrointestinal colecistoquinina. Las muestras biológicas se obtendrán de desoves espontáneos de L. guttatus los cuales se sembrarán en un sistema de circulación cerrada. Las larvas se separarán en dos grupos, el primero se mantendrá durante 35 días y será alimentado con alimento vivo, y el segundo será mantenido sin alimento hasta su muerte por inanición. Se realizarán muestreos a intervalos fijos y por medio de análisis de varianza o Kruskal Wallis, según sea el caso, se comparará la actividad y la expresión enzimática digestiva entre las larvas alimentadas y no alimentadas. Adicionalmente se describirán los patrones de actividad de las enzimas digestivas, y de expresión genética de enzimas y de la hormona colecistoquinina.

Palabras clave: Fisiología digestiva, Lutjanus guttatus, enzimas digestivas, hormona colecistoquinina